А если я забыл отметить выгрузку по ...

До тех пор, пока вы не отметитесь в последнем пункте выгрузки текущего заказа, он будет считаться невыполненным. Соответственно, заказчик не оплатит вам этот заказ до тех пор, пока его статус не поменяется на Выполнен. Но вы можете принимать и выполнять другие заказы параллельно, догрузы например.